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Spatial Modelling of Species and Biodiversity

  • Enseignant(s):   A.Guisan  
  • Titre en français: Modélisation spatiale des espèces et de la biodiversité
  • Cours donné en: anglais
  • Crédits ECTS: 3 crédits
  • Horaire: Semestre de printemps 2021-2022, 2.0h. de cours + 1.0h. d'exercices (moyenne hebdomadaire)
  •  séances
  • Formations concernées:
    Maîtrise universitaire ès Sciences en économie politique

    Maîtrise universitaire ès Sciences en management, Orientation comportement, économie et évolution

    Maîtrise universitaire ès Sciences en management, Orientation marketing

    Maîtrise universitaire ès Sciences en management, Orientation business analytics

    Maîtrise universitaire ès Sciences en management, Orientation stratégie, organisation et leadership
  • Permalink:



       

 

Objectifs

Species distribution models (SDMs) are increasingly important in ecology and conservation biology. This course proposes an introduction to these models and related concepts and methods. Overview of the main steps of model building. Advantages and limitations. Applications to various domains (climate change, invasions, rare species, ...).

Contenus

Chap. 1. Introduction to species' niche & distributions, and related models. Theory and principles behind these models. Competition and disperal limitations. Types of response variables, main predictive modelling approaches, field sampling design, from predicting species distributions to predicting communities. Chap. 2. Model calibration. Presence-only versus presence-absence data, statistical theory and methods for presence-only data, regressions and classifications for presence-absence, ensemble modelling and forecasting. Chap. 3. Model evaluation. Internal versus external evaluation. Data and metrics for evaluation. Crossvalidation, jackknife, bootstrap, uncertainties. Chap. 4. Assumptions behind these models. Pseudo-equilibrium, niche conservatism, niche completeness, realized niche, and other postulates.

Références

Guisan, A. & Zimmermann, N.E. (2000). Predictive habitat distribution models in ecology. Ecological Modelling 135(2-3): 147-186. Guisan A, Thuiller W (2005) Predicting species distribution: offering more than simple habitat models. Ecology Letters, 8, 993-1009. Guisan et al. (2013) Predicting species distributions for conservation decisions. Ecology Letters 16: 1424-1435.

Pré-requis

If possible, course 'Spatial Analyses & GIS' (ANSPAT) in 1st semester of the Master (not strictly required). Course open to regular students in the BEE orientation Course not open to mobility students

Evaluation

1ère tentative

Examen:
Sans examen (cf. modalités)  
Evaluation:

EXAMEN ORGANISE PAR L'ECOLE DE BIOLOGIE 1/2 written report, 1/2 oral presentation

Rattrapage

Examen:
Sans examen (cf. modalités)  
Evaluation:

Examens organisés par l'Ecole de Biologie. Contrôle continu. 1/2 Rapport des travaux pratiques, 1/2 présentation d'article.



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